Proteíny

Last updated 19 Sep 23 Edit Source

• Biomolekuly

See also: Proteínová biosyntéza

U eukaryotov je 21 proteínogénnych aminokyselín
Všetky okrem Gly, Cys a Sec sú v S konfigurácií na alfa-uhlíku
Pričom Gly je achirálny a Cys a Sec obsahujú kyslíku nadradený atóm (S, Se)

Zwitterion:
Látka s viacerými vnútornými nábojmi
Amino kyselinové zwitterióny sú prevelantné pri izoelektrickom bode
izoelektrický bod -> pH, ktoré je priemerom pKa amino skupiny a karboxylovej skupiny

Nekódované:
Kanonických amk (kódovaných v univerzálnom genetickom kóde) je 20

• $\textbf{Selenocysteín}$ -> nemá vlastný kodón, kódovaný SECIS elementom v 3’ UTR -> zastaví transláciu UGA (stop) kodónu
  Existuje 25 ľudských selénoproteínov
• $\textbf{Pyrrolyzín}$ -> iba u niektorých archeónov a baktérií
  V enzýmoch na produkciu metánu
• $\textbf{Hydroxyprolín}$ - vzniká post-translačnou modifikáciou

todo: post translational modification

Neproteínogénne:
Patrí sem niekoľko dôležitých látok
$\textbf{karnitín, GABA, hydroxyprolín, selenomethionín}$

Neproteínogenné funkcie aminokyselín:

• Tryptofán je prekurzorom serotoninu
• Tyrozín a Fenylalanín sú prekurzorom viacerých neurotransmiterov
• Glycín je prekurzorom poryfyrínov

Aminokyseliny sa delia na ketogenické a glucogenické (niektoré su obe naraz)
Sú týmpádom používané pri ketogenéze a glukoneogenéze

Štruktúra bielkovín sa delí na 4 stupne:

• primárna - poradie AMK
• sekundárna - usporiadanie do $\alpha$-helixov a $\beta$-sheety
• terciárna - usporiadanie jedneho reťazca v priestore
• kvartérna - spojenie viacerých podjednotiek či s jónom

Pri denaturácii dochádza ku strate 2., 3. a 4. štruktúry